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海外科研新进展丨MIRA技术检测诺如病毒可视化装置

《Hybrid paper/PDMS microfluidic device integrated with RNA extraction and recombinase polymerase amplification for detection of norovirus in foods》

期刊名称:《Applied and Environmental Microbiology》

影响因子:3.9

研究团队:麦吉尔大学戴维斯夫人研究所病毒性疾病中心

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诺如病毒((HuNoV))属于杯状病毒科,可通过受污染的食物传播,是引起急性胃肠炎的主要原因。

加拿大麦吉尔大学戴维斯夫人研究所病毒性疾病中心联合发表了相关检测研究。课题组开发了一种折纸微流控装置,使用小鼠诺如病毒1(MNV-1)作为诺如病毒的替代品。该折纸微流控装置通过试纸条吸收RNA,使用MIRA多酶恒温快速核酸扩增技术进行RNA扩增,以及试纸条横向流动分析。整个检测过程和结果可视化,检测在35 min内完成,且特异性100%、检测限为200 PFU/mL。该装置在偏远和资源环境中检测农业食品中的食源性病毒方面具有巨大的潜力。

实验方法

纤维素纸条吸收了MNV-1 RNA,随后将其释放到MIRA试剂中,RNA首先被逆转录成互补DNA(cDNA),然后扩增成双链DNA(dsDNA),接着探针与目标序列进行了特异性的结合,碱性四氢呋喃(THF)残基被内切酶IV裂解,使链被聚合酶延伸。扩增子被捕获,在T线上产生视觉信号。

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实验开发成果

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课题组开发了一种折叠的纸/PDMS微流控装置,该装置结合了核酸提取、等温核酸扩增、可视化检测多种功能,可以无缝集成从样品制备到MNV-1的终点检测。

该微流控装置在35 min范围内完成检测,检测限均为200 PFU/mL。并且每个微流控设备的成本计算为6.76美元,为课题组目前已知的所有检测方法中最便宜的。


实验价值

课题组进一步评估了这种微流控装置在莴苣和覆盆子中检测MNV-1的性能,将粗MNV-1 RNA提取物引入新鲜农产品样品中,不需要复杂的病毒RNA浓度和纯化步骤,在生菜中检测到170 PFU/g、在树莓中检测到230 PFU/g。

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而传统的检测食品中病毒的分子分析方法,PCR和qPCR需要高纯度的病毒颗粒,这使病毒从食品基质中的洗脱、浓度和纯化变得复杂。并且传统方法需要复杂、笨重和昂贵的设备,不适合在资源有限的环境中使用。

该装置在快速检测食品供应链中的HuNoV和其他食源性病毒方面具有重要价值。

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