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MIRA结合Cas12a快速检测儿童呼吸道疾病

急性呼吸道感染是儿童常见的呼吸道疾病,通常由病毒引起。呼吸道合胞病毒(RSV)和呼吸道腺病毒(ADV)是引起儿童急性呼吸道感染的两种常见病原体。轻度者可引起常见的感冒症状,如咳嗽和流鼻涕,而严重者可出现严重的并发症,如肺炎和中耳炎。根据世界卫生组织的建议,病原体的检测需要具备快速、准确、敏感、特异性的特点,不应依赖专门的技术人员或大型仪器。因此,开发一种能够满足上述检测要求的RSV和ADV的检测方法尤为重要。

深圳儿童医院儿科研究所的马东礼主任课题组在《Scientific Reports》期刊上发表文章《A multiplex recombinase polymerase amplification assay combined with CRISPR/ Cas12a for the detection of respiratory syncytial virus and respiratory adenovirus》,影响因子4.6。

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研究概述

多酶恒温快速核酸扩增技术MIRACRISPR/Cas检测系统相结合。通过设计MIRA引物和CRISPR rna(crRNAs),多序列比较,优化反应条件,并使用荧光数值检测装置,验证灵敏度和特异性。

并且qPCR结果作为比较对照,研究了160例临床咽拭子样本的检测结果的一致性。

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(MIRA-CRISPR/Cas12a检测法检测步骤示意图)


实验结果

1. MIRA-CRISPR/Cas12a检测方法灵敏度和特异性

MIRA方法检测中,使用RSV-F1/R1引物对从RSV、ADV、PIV、RhV、MP、CP、FluB、hMPV、FluA或RSV/ADV合并感染患者的咽拭子样本中扩增核酸。除RSV和ADV有扩增条带,其他结果均为阴性,说明所选MIRA引物与检测的其他8种病原体未发生交叉反应,且保守性良好。

随后,使用无菌水对RSV和ADV重组质粒进行10倍梯度稀释,对RSV和ADV的检测限均为106copies/mL。

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1-10:分别为RSV、RSV/ADV合并感染患者咽拭子样本以及其他呼吸道病原体样本

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1-6:107102稀释质粒DNA;7:阴性对照)

2.与qPCR做对比

qPCR方法相比,RSV和ADV的检出限均为103copies/mL

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(qPCR检测RSV和ADV的灵敏度

       MIRA-CRISPR方法更适合基层实验室,检测时间短,操作简单,无需大型qPCR仪器即可完成实验操作。

3.临床样本对比

从急性呼吸道感染的儿童中采集咽拭子样本160例。同时使用MIRA-CRISPR方法、qPCR方法进行检测,并将结果与临床试验结果进行比较

qPCR方法相比,MIRA-CRISPR方法RSV和ADV的敏感性分别为98.1%和91.4%,检测特异性均为100%。Kappa值大于0.95,表明其一致性程度较高。

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MIRA-CRISPR方法对RSV和ADV的检测具备快速、灵敏、特异性强的优势。它能及时准确地检测到病毒感染,更加适合于医疗资源匮乏的地区使用

(上述数据等信息均来源于原文,链接:http://www.shzcfeed.com/vip_doc/28304219.html)



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